Poco se conoce la fecha de fundación y de la procedencia del Amazonas FC, club de idéntico nombre que el que participó en la Temporada 2008/09 en la misma categoría, pero no tienen relación uno con el otro, aunque tienen similitudes, ambos tuvieron sede en Puerto Ayacucho, Estado Amazonas y que ambos participaron apenas una temporada, en Tercera División. En el 2018.

Este Amazonas FC debutó el 7 de abril del 2018 con empate sin goles ante la filial del Atlético Venezuela, durante el Torneo Apertura finalizó 4to de 6 equipos, con 14pts. con un récord de 4 victorias, 2 empates y 4 derrotas. Durante el Clausura tuvieron menos suerte, finalizando penúltimo con 2 victorias, 1 empate y 3 derrotas.

El club amazónico no salió en el siguiente torneo y poco se conoce de si se mantiene activo. Cerrando con apenas una temporada en el profesional.